EDI 系统组成一般包括报文生成和处理模块、格式转换模块、通信模块、联系模块四个部分，各部分的功能简单说明如下：
1．报文生成和处理模块

该模块的一个功能是按照 EDI 的公共标准生成所需要的报文和单证，然后交给其他模块处理。另一个功能是把贸易伙伴发来的报文进行分类处理，并给对方以相应的回答。

2．格式转换模块

该模块的主要功能是把企业自己生成或是其他企业发来的各种 EDI报文， 按照一定的语法规则进行处理， 从而形成标准化、结构化的报文、以方便其他模块做其他处理。

3．通信模块

该模块是企业本身的 EDI 系统和其他企业的接口， 其主要功能是执行呼叫、响应、确认身份和报文传送等。

4．联系模块

该模块的主要功能是为 EDI 用户提供良好的接口和人机界面， 同时也是 EDI 系统和企业内部其他系统进行信息交换的纽带。